Après une carrière de commissaire de la Marine, embarqué à bord de bâtiments de la Marine nationale, Xavier Prache prend les fonctions en 1998 de chef des ressources humaines de la direction du commissariat de la marine de Brest et secrétaire particulier du directeur. Il y mettra en place une gestion prévisionnelle des effectifs et une politique de formation du personnel civil adaptée. Il retrouve en 2001 l’île de la Réunion comme chef de la division finances de la direction du commissariat d’outre-mer des forces armées de la zone sud de l’océan Indien. Il supervisera pour l’ensemble des forces armées le passage à la monnaie unique européenne. 

Il intègre en 2003 la onzième promotion du collège interarmées de défense avant de prendre les fonctions de chef de la division action de l’Etat en mer auprès du préfet maritime de la Manche et de la mer du Nord à Cherbourg. Avec le transfert à Brest – presqu’île de Crozon – de l’école des officiers du commissariat de la marine en 2005, il en est nommé commandant en second et directeur de l’enseignement. Il participera aux premiers travaux d’élaboration de la formation initiale commune des commissaires et accueillera au sein de l’école la première promotion qui préfigure la future école des commissaires des armées. Il retrouve pour la dernière fois en 2008 le porte-hélicoptères « JEANNE D’ARC ». Il en dirigera les travaux de désarmement pour les domaines relevant du commissariat au retour de la dernière campagne d’application du navire école. 

Après avoir rallié comme officier traitant le bureau politique des ressources humaines de l’état-major de la marine à Paris en 2010, il est détaché en 2011 auprès de la Principauté de Monaco pour servir comme aide de camp de Son Altesse Sérénissime le Prince Albert II de Monaco. 

Il rejoint en 2012 comme directeur adjoint le centre interarmées d’administration des opérations, bras armé du service du commissariat des armées pour le soutien administratif et financier des opérations extérieures. En 2013, il est désigné directeur du commissariat d’outre-mer à Fort de France et chef du groupement de soutien de la base de défense des Antilles. Il y assure le soutien des forces armées en Martinique et en Guadeloupe ainsi que les fonctions de pouvoir adjudicateur et de service exécutant. De retour en 2015, il est le premier chef du bureau administration et soutien commun de l’état-major de la marine, assurant ainsi l’interface entre le service du commissariat des armées et la marine.