Sur terre comme en mer, la Nouvelle-Calédonie apparaît comme un sanctuaire de la biodiversité mondiale, avec un taux d’endémisme des espèces d’environ 80 %. L’archipel est l’un des 35 « hotspots » de biodiversité, identifiés sur la planète.

S’agissant de la biodiversité marine, la Nouvelle-Calédonie possède la deuxième plus longue barrière récifale du monde. Cette dernière abrite 20 % de la biodiversité mondiale et plus de 9 000 espèces marines dont notamment 400 espèces de coraux, 2 000 espèces de mollusques, 4 000 espèces de crustacés, 2 300 espèces de poissons, 26 espèces de requins, 12 espèces de serpents marins, 27 mammifères marins et 5 espèces de tortues. Certaines espèces sont particulièrement surveillées et font l’objet de plans d’actions dédiés comme les tortues marines ou les dugongs, aussi communément appelés « vache marine ».